Estudio de DNA en restos biológicos

Con el estudio de DNA en restos biológicos se pueden abordar unas series de problemáticas relacionados a análisis de DNA por casos forenses, análisis de DNA para la identificación de vegetales y  análisis de DNA en agentes infecciosos.  Debajo se presentan algunos ejemplos de las aplicaciones que se pueden abordar.

 

  • Determinación  de DNA en victimas de conflictos y persecuciones
  • Análisis de DNA para la identificación de semillas antiguas
  • Análisis de DNA en bacteria, hongos y  virus conservados  en tejidos y huesos humanos antiguos

 

Determinación  de DNA en victimas de conflictos y persecuciones

La secuenciación de DNA se pueden llevar a cabo en el caso de de persecuciones y conflictos siempre que los familiares de la victima estén vivos y sean identificados. Esto ayudaría en la identificación y reconstrucción de los hechos como la devolución del cuerpo a la familia (Szleszkowski et al. 2014). Siendo el DNA de victimas enterradas fácilmente expuesto a contaminación controles sobre la calidad de DNA y el impacto de la contaminación son necesarios (von Wurmb-Schwark et al. 2008).

 

Análisis de DNA para la identificación de semillas antiguas

El análisis de DNA  en semillas antiguas se pueden llevar a cabo dependiendo del estado de conservación, siendo más complicada la conservación del DNA en caso la semilla ha sido sometida a un  proceso de cocción. La identificación del DNA de una semilla podría ser de gran interés  para conocer las especies más cultivadas en un dato periodo en una región y determinar el proceso de expansión geográfica de una determinada especie (Fernández et al., 2013).

 

Análisis de DNA en bacteria, hongos y  virus conservados  en tejidos y huesos humanos antiguos

Bacteria, hongos y  virus en restos humanos antiguos se puede conservar en huesos y tejidos especialmente en calcificaciones como son los cálculos dentales. La identificación del DNA  de  estos agentes puede ser importante para conocer su evolución a lo largo de la historia que puede llevar a ensayar nuevas metodologías para combatir la nuevas versiones de estos agente infecciosos. El interés hacia el estudio de los agentes infecciosos originales está creciendo por la creciente alerta hacia las modernas versiones que han desarrollado resistencia a los antibióticos (Preus et al. 2011).

 


Equipamiento:

 

Espectrometría Atómica

-Espectrómetro de Emisión Óptica de Plasma Acoplado Inductivamente (ICP-OES), Perkin  Elmer,  5300  DV.

-Espectrómetro de Masas con Plasma Acoplado Inductivamente  (ICP-MS), Perkin  Elmer,  Elan  DRCII.

-Espectrómetro de Absorción atómica con atomización en llama (FLAME-AAS), Perkin Elmer, 1100.

-Espectrómetro de Absorción atómica con atomización electrotermica (ET-AAS), Perkin Elmer,  AAnalyst 600.

-Espectrómetro de Fluorescencia Atómica acoplado a la  Generación de  Hidruros (HG-AFS), PS-Analytical, Millenium.

-Espectrómetro de Fluorescencia Atómica para mercurio (CV-AFS), PS-Analytical, Excalibur.

-Analizador de Mercurio (SOLID CV-AAS).  Milestone, DMA-80.

-Espectrómetro portátil de Fluorescencia de RX  de dispersión de energía, (ED-XRF). Bruker, S1Titan.

 

Cromatografía

-Cromatógrafo de gases con detector de masas de cuadrupolo (GC-QMS), Agilent Technologies, GC 7890.

-Cromatógrafo de gases con detector de masas de trampa iónica (GC-ITMS), Thermo Scientific, Polaris Q.

-Cromatógrafo de gases (GC) con detectores FID y NPD (GC-FID y NPD), Agilent, GC 5890.

-Cromatografo Liquido (HPLC),  con detectores de diodos (LC-DAD), fluorescencia molecular (LC-F) e índice de refracción (LC- IR), Agilent, 1100 Series.

-Cromatógrafo Liquido (HPLC) con detector UV-visible, Agilent, 1050 Series.

-Cromatógrafo Liquido (HPLC) con detector UV-visible, Dionex, P680.

-Movilidad iónica (IMS). Smiths, IONSCAN-LS.

-Cromatógrafo iónico (IC)  con supresión iónica y detector de conductividad, Metrohm, serie 8.

 

Fluorescencia Molecular

-Espectrómetro de absorción infrarroja cercana y media por transformada de Fourier (FT-NIR/MIR), con detectores DTGS y MCT, Bruker, IFS/66v/s.

-Espectrómetro de absorción infrarroja media por transformada de Fourier (FT-MIR), Bruker, Tensor 27.

-Espectrómetro de absorción infrarroja cercana por transformada de Fourier (FT-NIR), Bruker, MPA.

 

Microscopia

Instrumentación situada en el Servicio Central de Apoyo a la Investigación Experimental de la Universidad de Valencia (SCSIE):

-Microscopia Óptica: Leica DMR, DM IRBE y M165; Olympus FV1000MPE, FV1000, Fluoview FV10iW, BH-2 y SZH; IN Cell Analyzer 2000; Nikon SMZ.

-Microscopia Electrónica: Fei TECNAI G2 F20; Jeol JEM-1010; Hitachi S-4800 y S-4100;  Philips XL 30 ESEM.

 

Genómica

Instrumentación situada en el Servicio Central de Apoyo a la Investigación Experimental de la Universidad de Valencia (SCSIE):

-Equipo de secuenciación de DNA ABI 3730 (48 capilares).

-Equipo de secuenciación de DNA ABI 3730XL (96 capilares).

-Equipo de secuenciación masiva SOLID 5500XL (Life technologies).

-Equipo de secuenciación masiva 454 GS Junior (Roche).

-Sistema de PCR en tiempo real StepOne Plus  (Applied Biosystems).

-Sistema de caracterización de bacterias Riboprinter (Qualicon).

-Bioanalizador Experion  para el análisis de DNA y RNA (Bio-Rad).

-Bioanalyzer 2100  para el análisis de DNA y RNA(Agilent).

-Espectrofotómetros Biophotometer (Eppendorf) y Nanodrop 2000 (Termo Scientific).

-Espectrofluorímetros Qubit (Invitrogen) y QuantiFluor (Promega).

-Termocicladores: ABI 9700 y ABI 2700.

-Sistema convencional de electroforesis de DNA en geles de agarosa.

-Pequeño equipamiento para trabajo en el laboratorio de genómica.

 

 

Instrumentación de  preparación de muestras

-Triturador de mandíbula. Retsch, BB 50.

-Molino. Retsch, ZM 200.

-Microondas, Milestone, Ethos Sel.

-Fluidos presurizado, Applyed Separation, Fast PSE.

-Horno Mufla con controlador Eurotherm 2416, Lenton, ECF 12145A

 


Información adicional:

  • Puede emitir informe en inglés: Sí
  • Ensayo certificado: No
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